病害就是指雞腿菇在生長發育過程中，因受其他有害微生物 的侵擾或環境條件不適宜．使其不能正常進行生長發育，甚至 死亡，對生產造成損失的現象。雞腿菇病主要有以下幾種：
(1)褐腐病
本病發生于菇體及培養料面的菌絲上，起初被病菌侵入的 部分長出白色棉毛狀的菌絲，其表面逐漸流出暗褐色的液體．病菌進一步蔓延之后，雞腿菇菌蓋表面會產生瘤狀突起，菌柄 畸形膨脹-菇體變形，變質發出腐臭味最后爛掉。
防治措施：栽培場所周圍和菇棚內的地面及四壁噴灑500 倍多菌靈溶液或100倍抗菌先鋒，并噴灑菊脂農藥，防止害蟲潛入。
覆土用遠離菇棚的新鮮土，在土中噴灑500倍多菌靈溶液 或1oo倍抗菌先鋒溶液。
發病時加大菇棚通風量，降低棚內濕度，將溫度降至15℃以下，在病區噴灑500多倍多菌靈。發病嚴重時，去掉原有的覆土，將病菇燒掉，所用工具進行消毒。
（2）軟腐病
發生此病時，床面覆土周圍出現白色霉斑，若不及時處理，霉斑便迅速蔓延，并變成水紅色。在雞髓菇整個生長發育階段都會受到這種病害的侵染，被侵染的料面，一般不出菇，少數子實體受到浸染后，并不發生畸形，但后期病斑可接連成片，逐漸變成褐色直至腐爛。
防治措施：局部友生時噴灑500倍多菌靈溶披，降低±面和空氣濕度，患病部位撒生石灰粉。
(3)雞爪菌
雞爪菌學名叫總狀炭角菌，是雞腿菇生產中常見且危害較嚴重的病原菌，可造成減產甚至絕收。
總狀炭角菌絲與雞腿菇菌絲混合在一起，其傳播方式及與雞腿菇是拌生，寄生、還是感染，是寄生性雜茁還是競爭性雜菌等問題目前學術界尚無定論，具專家分析．。主要與菌種攜帶及栽培環境有關。在舂、秋季節，溫度高于20度時．授易出現，多在二潮菇以后出現。
